System WMS zbierając odpowiednie dane umożliwia rzetelną ocenę pracy magazynu mierząc kluczowe czynniki wydajności. W każdej chwili dostępna jest informacja o stanach magazynowych oraz aktualnej ilości zadań do wykonania. Na podstawie raportów możliwa jest weryfikacja wydajności pracowników. Firmy świadczące usługi logistyczne doceniają możliwość rejestrowania usług cennikowych dla każdego odbiorcy takich jak np. składowanie, kompletacja, załadunek, co-packing i inne.

Wraz z wdrożeniem systemu WMS następuje jakościowa zmiana organizacji pracy i obsługi przepływu ładunków. Magazyn jest uporządkowany, możliwa jest ciągła inwentaryzacja każdej lokacji. System monitoruje punktualność i kompletność wysyłki. Możliwe jest śledzenie poszczególnych cech produktów takich jak seria czy data ważności, przestrzeganie jednorodności towarów w lokacji, wymuszanie zasady FIFO lub FEFO. Miejsce składowania towarów jest wyznaczane na podstawie algorytmów uwzględniających wymiary i ciężar produktu, jego właściwości, grupy towarowe oraz dozwolone strefy magazynowe. Towary w magazynie są identyfikowane za pomocą kodów kreskowych, co wpływa na wyeliminowanie błędów, a co za tym idzie zmniejsza się ilość reklamacji i zwrotów.